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裸子植物發生發展的歷史悠久，最初的裸子植物出現約在34500萬年前至39500萬年之間的古生代泥盆紀，歷經古生代的石炭紀、二疊紀，中生代的三疊紀、侏羅紀、白堊紀，新生代的第三紀、第四紀。從裸子植物產生到21世紀，地質氣候經過多次重大變化，裸子植物種系也隨之多次演變更替，老的種類相繼滅絕，新的種類陸續演化出來，種類演替繁衍至今，現代的裸子植物有不少種類是從約250萬年前至6500萬年之間的新生代第三紀出現的，又經過第四紀冰川時期保留下來，繁衍至今。
被子植物是當今世界植物界中最進化、種類最多、分布最廣、適應性最強的類群。現知全世界被子植物共有20多萬種，占植物界總數的一半以上。裸子植物門是植物界的1門，既是頸卵器植物，又是種子植物，它們有胚珠，但心皮不包成子房，且胚珠***，胚乳（即雌性原葉體）在受精前已形成。
